2011年11月28日

mitosisの初歩

mitosisの初歩
G2→Mにまだまだ問題があるが、mitosisを少しやってから
再度調べたい。
mitosisの文献を読む最初の課題は段階の言葉である。
調べてもすぐ忘れる。言葉の意味をよく調べる。
prophase,metaphase,anaphase,telophase,interphaseとある。
interphaseはmitosis段階以外の総てで、G1,S,G2を含む。
metaphaseは染色体が中央に並ぶ時期だが、metaとは何か?
辞書には色々な意味がかいてあるがchange,amongが基本の
ようだ。ここの意味ではamong「中間」をとりたい。
高校化学教科書のベンゼン核でオルト、メタ、パラというのを
やる。パラは反対側で、metaは中間の意味だ。中間に並ぶ時期。
anaは離れるの意味。analyzeは分解して調べること。
中間にならんだ染色体が離れていく過程の時期。
telo=telで離れただが、telomereとtelophaseは両端にある。
この感覚に差があるのかは解からない。

活性化したCyclinB-Cdk1によりG2→M移行が起き、並んだ
染色体が左右に引かれM期が終わりの移行していく段階で
CyclinBがユビキチン化されて分解されて行くように、
M期の複雑な進行が次に移行するには常に、役目の終わった
物質を処理していく仕組みがあるようだ。
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2011年11月20日

G2→Mの整理のための下書き G2→Mの整理のための下書き

G2→Mの整理のための下書き
CDK1にcyclin B が付くとCAK(CDK-activating kinase)により
161番目のスレオニンがりん酸化される。
次に、Wee1により、Y15が、Myt1によりT14とY15がりん酸化される。
T14,Y15がりん酸化されると、G2→Mの進行が阻止される。
転写が終了していなかったり、転写ミスがあるとき、分裂を
阻止する仕組みである。
Wee1,Myt1の作用する段階でCDK1-cyclinB complexは細胞質から
核に移行するらしい。mitosisの初期に核膜の消失があるから
それに関係するかもしれない。後述。
転写が完了し移行準備が整うと、phosphataseであるCdc25に
よって、T14,Y15が除かれるとATP結合部位が現れ分裂が
開始される。
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2011年11月14日

CDK1=cdc22のT14,Y15のりん酸化の意味

1,
Mutations of p34cdc2 phosphorylation sites induce premature mitotic events in HeLa cells
: evidence for a double block to p34cdc2 kinase activation in vertebrates.
Krek W, Nigg EA.
EMBO J. 1991 Nov;10(11):3331-41.

2.
Differential phosphorylation of vertebrate p34cdc2 kinase
at the G1/S and G2/M transitions of the cell cycle
: identification of major phosphorylation sites.
Krek W, Nigg EA.
EMBO J. 1991 Feb;10(2):305-16.

1,
細胞回転のS期になると、T14,Y15,T161,S277が燐酸化される。
G2期になると、S277,T161はほぼ脱燐酸化され、T14,Y15だけに
なる。
T14,Y15はATP-binding siteにあり麟酸化はATP結合を阻止している。
これがはずされると、M期に入る。
2、
T14,Y15の部位が変異した動物を作った。
S期にDNA転写が終わらないうちに、check pointが働かないので
分裂期に入ってしまう。
M期に入ったことをHistone H1 kinaseを測って調べている
のだが、その意味はまだ未確認。
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2011年11月02日

Cdc25によるG2→Mの制御

ole for the PP2A/B56delta phosphatase in regulating 14-3-3 release
from Cdc25 to control mitosis.
Margolis SS, Kornbluth S.et al
Cell. 2006 Nov 17;127(4):759-73.

cell cycleのG2→Mの進行はCdc2/CyclinBが活性化すると移行するが
Cdc25が活性化されないと進行しない。
Cdc25の287番目のセリンが燐酸化され、更に14-3-3が付くとCdc25は
非活性型になる。
蛋白に燐酸を付け活性化するキナーゼは多くの基質毎に沢山ある。
それに対して、燐酸を取り除くphosphataseは種類が少ない。
補助する蛋白が基質を指定したりする。
この場合のphosphataseはPP2Aで,PPはprotein phosphataseで
B56deltaという蛋白がくっ付いて、協同ではたらく。
この論文はその時にkeratinが必要だと言っているのだが、
まだ追試確認の論文がない。

この論文は287番目のセリンの燐酸化の役目について述べて
いるのだが、他に14番目のスレオニンと15番目のチロジンの
燐酸化も大事な問題であるが、それとの関係が私には
未解明な問題。続きを読む
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2011年10月26日

柳田充弘先生が文化勲章を受章

柳田充弘先生が文化勲章を受章された。
染色体分配・伝達制御機構で検索して先生のPDFをお読みください。
このブログで取り上げているG2→M期の問題からM期の染色体の
動きなど関連が深い。私がとりあげた文献の更に前にその基礎を
研究されていたことがわかる。先生でも進歩が速くて追いつくのが
大変とあり安心?した。
最近取り上げる文献は難しくて不消化で読まれる方に申し訳ない
のですが、混乱期は進歩のためにお許しください。
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2011年10月25日

混乱するG2→M

Many fingers on the mitotic trigger:
post-translational regulation of the Cdc25C phosphatase.
Hutchins JR, Clarke PR.
Cell Cycle. 2004 Jan;3(1):41-5. Review
細胞回転のG2→Mの転換はCDK1/CyclinBが係わるが、この活性化を
Cdc25が調節しているが、このCdc25を調節しているものが、
色々ある。生物学の重要部分であり、癌増殖、多くの抗がん剤が
この部分で開発中であるが、同じ機構が認知症に関係してくる。
CAMP→PKA(protein kinase A)→
Ca++→CamKU(calmodulin-dependant protein kinase U)→
C-TAK1(これもカルモデュリン関係のキナーゼ)→
replicating DNA→CHK1(チェックポイント)→
dsDNA ends→Chk2→
other stress signals→other kinases?
以上が燐酸を一つ付ける(主に161のチロジンか?)

これにさらに二つの燐酸を付ける14-3-3
これから二つの燐酸を取り除くPP2A
これ等の情報が、2004年の段階でこの著者は混乱し
収拾がつかなくなっている。この著者の最後の論文。
急展開している時期の論文は難しい。
posted by ヘフティー at 15:00| Comment(0) | 日記 | このブログの読者になる | 更新情報をチェックする

2011年10月14日

G2/Mチェックポイント

G1→S→G2→M
細胞周期エンジンがstage,phaseを進行させる。
エンジンはCDKcomplex
CDKcomplex=CDK+サイクリン
CDKはcyclin dependant kinase
ATPもCDKに結合する。
CDK complexがいつ、何に作用するかはサイクリンが決める。
CDKは各種に共通な名前。種、特有な場合は
出芽酵母の場合CDC,分裂酵母の場合cdc、ヒトの場合Cdcと表す。
cdc=cell division cycle
stageの移行にチェック機構もある。
G1→Sには、サイクリンAとCDK2
G2→Mには、サイクリンBとCDK1が関係。

G2/M チェックポイント
CDK1の活性化にT14,Y15,T161
14番目、と161番目のチロジンと15番目のスレオニンの燐酸化が重要。
CAKとはCDK-activating kinase。
CAKは161番目のチロジンを燐酸化する。
これを更に、Wee1が15番目のスレオニン、Myt1が16番目のチロジンを
燐酸化するとCDK2(ヒトではCdc2)は不活化する。
CAKはCDK1活性化酵素。
Wee1とMyt1は不活化酵素。

3つの燐酸化で不活化したCdc2から二つの麟をCdc25が取り除くと
再び活性化する。
Dephosphorylationによる活性化。
posted by ヘフティー at 19:15| Comment(0) | 日記 | このブログの読者になる | 更新情報をチェックする

2011年09月30日

アルツ研究の本命?Pin1を注目

Pin1に注目しよう。
Pin1というのは、propyl isomeraseで光学的異性体の
シスとトランスを変換する酵素で染色体が細胞分裂する時に
中央に並ぶ前に濃縮する、その濃縮に関係する点から
研究が始まった。それだけでも生物学的に重要なことで
あるが、活性化した蛋白質、つまり燐酸が結合した蛋白質に
結合する性質があった。
Pin1が結合するとその蛋白の処理、分解が亢進する。
アルツハイマーの原因として、燐酸化されたTauが蓄積し
paired helical filaments(PHFs)の説明になる可能性が
ある。
そうでなくとも、抗がん剤の作用機序、抗菌剤の作用機序などに
関係しそうで重要物質であることにかわりない。
勉強していきたい。
posted by ヘフティー at 18:00| Comment(0) | 日記 | このブログの読者になる | 更新情報をチェックする

感情と脳の部位

Curr Opin Neurobiol. 2002 Apr;12(2):169-77.
Neural systems for recognizing emotion.
Adolphs R.
Curr Opin Neurobiol. 2002 Apr;12(2):169-77.
happines,fear,anger,disgust,sadnessの表情の顔の絵を見せて
その時の脳の変化を電気生理学的に記録している。
脳のgyrusまでみているから、脳波や脳磁図ではそこまで
解からない?だろうから、開頭時に実験しているのだろうか?
文献がレビューなので細かい方法が解からない。
当然、脳のいろいろな部位が反応しているのだが、だから
どうだとも感じてしまい面白くない。
posted by ヘフティー at 17:41| Comment(0) | 日記 | このブログの読者になる | 更新情報をチェックする

2011年09月28日

アルツハイマーとミトコンドリア

1,
The Alzheimer's disease mitochondrial cascade hypothesis.
Swerdlow RH, Burns JM, Khan SM.
J Alzheimers Dis. 2010;20 Suppl 2:S265-79. Review.
2,
The Mitochondrial Cascade Hypothesis for Parkinson's Disease.
Cardoso SM.
Curr Pharm Des. 2011 Sep 9.
3,
Evidence for sub-haplogroup h5 of mitochondrial DNA as a risk factor for late onset Alzheimer's disease.
Santoro A, et.al
PLoS One. 2010 Aug 6;5(8):e12037.
4,
Lack of association between mtDNA haplogroups and Alzheimer's disease in Tuscany.
Mancuso M, et al
Neurol Sci. 2007 Jun;28(3):142-7.

アルツハイマーのミトコンドリアが形態的に異常だったり、mtDNAに変異があったりする。
ミトコンドリアの異常がアポトーシスの異常を起し、アルツハイマーやパーキンソンに
結びつけるアイディアがある。
neurodegenerative deseaseではよくあることという考えもある。
mtDNAのある型とアルツの発生に有位差を認める論文もあれば否定する論文もある。
posted by ヘフティー at 11:49| Comment(0) | 日記 | このブログの読者になる | 更新情報をチェックする

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