http://kaoya.seesaa.net/ アポトーシスの入門編を勉強するためにこのブログを始めたのですが領域が拡大アイマイに成りつつあり、オンコロジー、免疫学、分子生物学、分子発生学などと混乱を極めていますが、なるべく基礎からじっくりやっていけたらと思います。読んだ方にあんなことを知らなかったのかと思われるのは、慣れているので気にならないので、のんびりやりたいと考えています。現在のひっかかっている所は、（ここは適宜入れ替えます） 細胞分裂の生物学 です。レトロウイルスはとても複雑なので「レトロウイルスをさらおう」というブログに独立させましたが最終段階のcore とenvelopeの組み立てで行きづまり休憩します。勉強不足なのか、研究段階なのか不明です。 ja http://kaoya.seesaa.net/article/133967853.html 1,Inflammatory Bowel Disease and Mutations Affecting the Interleukin-10 Receptor.Glocker EO, et alN Engl J Med. 2009 Nov 19;361(21):2033-2045.2,Interleukin-10 in Inflammatory Bowel Disease.Kelsall B.N Engl J Med. 2009 Nov 19;361(21):2091-2... 日記 ヘフティー 2009-11-26T15:29:40+09:00 Inflammatory Bowel Disease and Mutations Affecting
the Interleukin-10 Receptor.
Glocker EO, et al
N Engl J Med. 2009 Nov 19;361(21):2033-2045.
2,
Interleukin-10 in Inflammatory Bowel Disease.
Kelsall B.
N Engl J Med. 2009 Nov 19;361(21):2091-2093.
これは１の編集者の解説
3,
Inflammatory Bowel Disease.
Abraham C, Cho JH.
N Engl J Med. 2009 Nov 19;361(21):2066-2078.
これは一般的な解説で面白くない。

さて１、だがまずInterleukin-10の予習をしよう。
>http://www.medience.co.jp/research/04_11.html
いい解説ですでにIL-10と炎症性大腸疾患の関連が推測
されていたことが解かる。１ではその受容体に変異がおきて
いる患者の報告。IL-10は炎症を抑制する働きがある。
患者のマクロファージをLPSで刺激すると、正常人と同様に
炎症性のTNF-αが大量にでる。IL-10を同時に投与すると
正常人では炎症が抑制されて、TNF-αが出なくなるが
患者検体では抑制されない。その患者に骨髄移植をしたら
病気が治ったという。 ]]>オススメ・スポンサーサイト： http | www | 移植 | 病気 ]]> http://kaoya.seesaa.net/article/133733177.html 細胞回転にはG1→S→G2→M→G1と続く。G1からSに入る時に第一チェックポイント。G2からMに入る時に第二チェックポイント。さらにM期に濃縮した染色体が中央に並び両極に引かれる時、紡錘体形成チェックポイントがある。染色体長腕、短腕の狭窄部のDNA部分をセントロメアといい、紡錘体の付着部をキネトコアと呼び、セントロメア蛋白質（CENP)、モーター蛋白質、紡錘体チェックポイントの３部分からなる。並んだ姉妹染色体を一時的にくっつけておくものを「コヒーシン」という。強皮症で出てく... 日記 ヘフティー 2009-11-23T23:09:50+09:00 G1→S→G2→M→G1と続く。
G1からSに入る時に第一チェックポイント。
G2からMに入る時に第二チェックポイント。
さらにM期に濃縮した染色体が中央に並び両極に引かれる
時、紡錘体形成チェックポイントがある。
染色体長腕、短腕の狭窄部のDNA部分をセントロメアといい、
紡錘体の付着部をキネトコアと呼び、
セントロメア蛋白質（CENP)、モーター蛋白質、紡錘体チェックポイントの３部分からなる。
並んだ姉妹染色体を一時的にくっつけておくものを「コヒーシン」という。
強皮症で出てくるセントロメア抗体がこの部分の研究に役立ったそうだがまだ勉強不足です。 ]]>オススメ・スポンサーサイト： 勉強 ]]> http://kaoya.seesaa.net/article/133730307.html シャペロンとは貴族の娘などが社交界にデビューする時に指導世話をする女性のこと。核膜、ミトコンドリア膜などを通過する時に一種のtagがあることは前に書いた。インポーチン、エクスポーチンというものもある。高分子が大きくて通過できないとき、ほぐして通過させ通過後再度高分子に戻す作用がシャペロンにある。この時ATPが必要。素人が大工仕事をする時にちょっとそこを持っててよなどと頼むが、そういう仕事をするらしい。大型物質用、小型用などHSP60,HSP70などとあるらしい。この膜通過は細... 日記 ヘフティー 2009-11-23T22:43:00+09:00 世話をする女性のこと。
核膜、ミトコンドリア膜などを通過する時に一種のtagがある
ことは前に書いた。インポーチン、エクスポーチンというもの
もある。高分子が大きくて通過できないとき、ほぐして通過させ
通過後再度高分子に戻す作用がシャペロンにある。この時
ATPが必要。
素人が大工仕事をする時にちょっとそこを持っててよなどと
頼むが、そういう仕事をするらしい。大型物質用、小型用など
HSP60,HSP70などとあるらしい。この膜通過は細胞膜は含まれない。
それらはエンドサイトーシス、エクソサイトーシスという別の機構。
蛋白合成はアミノ酸が決まると一次構造、二次構造は自然に決まる
らしいが、さらなる高次構造を作る時は手助けが必要らしい。
その時もシャペロンという言葉を使うようで、定義にはアイマイさ
があるようだ。 ]]>オススメ・スポンサーサイト： デビュー | アミノ酸 ]]> http://match.seesaa.jp/ot_listing.pl?aid=628262&sid=kaoya&tid=seesaa_hotspot&k=%E3%83%80%E3%83%93%E3%83%B3%E3%82%B010&hid=35 ソフト ダビング10 | 販売 ダビング10 | 解除 ダビング10 | 逮捕 ダビング10 | ダビング10解除 ]]> 2009-11-23T22:43:00+09:00 ads by Seesaa http://kaoya.seesaa.net/article/133277509.html 糖尿病のコントロール評価にヘモグロビンA1c が使われてきたがA1Cに変わるそうだ。臨床的な意味の変化より世界の流れに流されたようだ。我々一般は正常値の変化くらいに考えてよいのだろう。その説明の中では専門家が日本のいつものように得意になって略号を使っていて、解説の意味をなしていない。略号の研究をしよう。JDS;Japan Diabetes SocietyNGSP;national glycohemoglobin standardization programIFCC;inte... 日記 ヘフティー 2009-11-18T20:30:29+09:00 A1Cに変わるそうだ。臨床的な意味の変化より世界の流れに
流されたようだ。我々一般は正常値の変化くらいに考えてよい
のだろう。その説明の中では専門家が日本のいつものように
得意になって略号を使っていて、解説の意味をなしていない。
略号の研究をしよう。
JDS;Japan Diabetes Society
NGSP;national glycohemoglobin standardization program
IFCC;international federation of clinical chemistry and laboratory
ADA;American Diadetes Association
EASD;European Association for the Study of Diabetes
IDF;The International Diabetes Federation ]]>オススメ・スポンサーサイト： International | Association | international | Japan | chemistry | national | American | 糖尿病 | コントロール | Society ]]> http://kaoya.seesaa.net/article/132815590.html Cancer-susceptibility genes. Gatekeepers and caretakers.Kinzler KW, Vogelstein B.Nature. 1997 Apr 24;386(6627):761, 763ページ数が変なのは中間が広告のため。遺伝子異常と発癌の仕組みに関する代表的な重要論文の一つだが難しい。gatekeeperというのは、門番のことだろう。caretakerというのが、管理人や介護者の意味がある。日本人には解からない英語だ。ma... 日記 ヘフティー 2009-11-13T17:38:00+09:00 Kinzler KW, Vogelstein B.
Nature. 1997 Apr 24;386(6627):761, 763
ページ数が変なのは中間が広告のため。
遺伝子異常と発癌の仕組みに関する代表的な重要論文の一つだが
難しい。
gatekeeperというのは、門番のことだろう。
caretakerというのが、管理人や介護者の意味がある。日本人
には解からない英語だ。mansionのイメージが違う。
具体的な「gatekeeper」としては、Retinoblastoma,von Hippel
Lindau,Neurofibromatosis type1,Adenomatous poliposis coli
などで、tumorのinitiationに関係する。
「caretaker」としては
(xeroderma pigmentosum);nucleotide-excision-repair gene
(hereditary nonpoliposis colorectal cancer);mismatch-repair
gene
(ataxia telangiectasia);ATM gene
BRCA1,BRCA2があり、DNA損傷修復機能の障害のようだ。
損傷した遺伝子つまり癌を慈しみ育てる介護の意味より
家の傷みを修理しながら維持する管理人のほうが正しいように
思うがどうだろう。 ]]>オススメ・スポンサーサイト： ATM | Nature | イメージ | type | 英語 | 介護 ]]> http://www.seesaa.jp/r.pl?id=30 2009-11-13T17:38:00+09:00 ads by Seesaa http://kaoya.seesaa.net/article/132537257.html Vaccination against HPV-16 Oncoproteins for Vulvar Intraepithelial Neoplasia.Kenter GG, et alN Engl J Med. 2009 Nov 5;361(19):1838-47.HPV-16のE6とE7に対するワクチンをつくり、intraepithelial neoplasia,grade3の20人に投与。1例は何故か脱落。12人は改善。内5人はCRでウイルスもいなくなった。局所にリンパ... 日記 ヘフティー 2009-11-10T16:55:04+09:00 Kenter GG, et al
N Engl J Med. 2009 Nov 5;361(19):1838-47.

HPV-16のE6とE7に対するワクチンをつくり、
intraepithelial neoplasia,grade3の20人に投与。
1例は何故か脱落。12人は改善。内5人はCRでウイルスも
いなくなった。
局所にリンパ球の反応がつよい。
]]>オススメ・スポンサーサイト： ウイルス ]]> http://kaoya.seesaa.net/article/132085269.html インクレチンに作用する新しい糖尿病薬Sitagliptinの使用後88人の急性膵炎がみられ内2名は重症らしい。ttp://www.fda.gov/Safety/MedWatch/SafetyInformation/SafetyAlertsforHumanMedicalProducts/ucm183800.htm 日記 ヘフティー 2009-11-05T12:38:09+09:00 88人の急性膵炎がみられ内2名は重症らしい。
ttp://www.fda.gov/Safety/MedWatch/SafetyInformation/SafetyAlertsforHumanMedicalProducts/ucm183800.htm ]]>オススメ・スポンサーサイト： www | 糖尿病 ]]> http://kaoya.seesaa.net/article/131968056.html BRCAに最も関係する癌はもちろん乳癌ですが、前回肺癌などと書き間違い申し訳ございません。訂正しておきました。BRCAの遺伝子が変異した時、情報転換translationがミスセンスやナンセンスになってBRCA欠損になる。欠損すると癌になりやすくなるので、癌抑制遺伝子だろうと想像ついたがその機構は現在でも明快にはなっていない。胎生期よりBRCAが欠損すると生存できないので癌抑制以外に重要な機能があるようだ。Embryonic lethality and radiation h... 日記 ヘフティー 2009-11-03T23:53:39+09:00 書き間違い申し訳ございません。訂正しておきました。
BRCAの遺伝子が変異した時、情報転換translationがミスセンス
やナンセンスになってBRCA欠損になる。欠損すると癌になりやすく
なるので、癌抑制遺伝子だろうと想像ついたがその機構は現在でも
明快にはなっていない。胎生期よりBRCAが欠損すると生存できない
ので癌抑制以外に重要な機能があるようだ。
Embryonic lethality and radiation hypersensitivity mediated
by Rad51 in mice lacking Brca2.
Sharan SK, et al
Nature. 1997 Apr 24;386(6627):804-10.
BRCA2はDNA修復蛋白であるRad51に結合する。
Rad51欠損は放射線損傷に修復機能がない。Radという名前が付いた
のもよく考えればそれらしい。これを書いていてやっと思いついた。
細菌のRad51にあたるものがRecAでrecはrecombinantの意味で
損傷した二本鎖DNAをヘリカーゼなどが修理して二本鎖を再構築
するようだ。
発癌の説明の一つ ]]>オススメ・スポンサーサイト： Nature | 放射線 ]]> http://kaoya.seesaa.net/article/131883842.html 乳癌の内１０％位は家族集積性があり蛋白BRCA1BRCA2が関係する。ファンコーニ症候群は尿細管の病気であり、BRCAと全く関係ない。ファンコニー貧血FAはアシュケナジー（東欧系のユダヤ人）に多い常染色体劣勢遺伝の病気で低身長、骨異常が多く、生後しだいにpancytopeniaから白血病を発症する。奇形などの異常も多い。mitomicinCやcisplastinや紫外線によりDNAが損傷しやすい。FAの原因蛋白のmutationの種類によりFANC-A,FANC-C,FANC... 日記 ヘフティー 2009-11-03T01:49:29+09:00 ファンコーニ症候群は尿細管の病気であり、BRCAと全く関係ない。
ファンコニー貧血FAはアシュケナジー（東欧系のユダヤ人）に多い
常染色体劣勢遺伝の病気で低身長、骨異常が多く、生後しだいに
pancytopeniaから白血病を発症する。奇形などの異常も多い。
mitomicinCやcisplastinや紫外線によりDNAが損傷しやすい。
FAの原因蛋白のmutationの種類により
FANC-A,FANC-C,FANC-D,FANC-E,FANC-F,FANC-G
FANCI,FANCJ,FANCL,FANCMがあり、他にFANCBとFANCNがあり
この二つだけX染色体上にある。
FANCD1やFANCJとBRCA２が同一遺伝子であった。 ]]>オススメ・スポンサーサイト： 紫外線 | mutation | 病気 ]]> http://kaoya.seesaa.net/article/130935555.html nteractions with pocket proteins contribute to the role of human papillomavirus type 16 E7 in the papillomavirus life cycle.Collins AS, Nakahara T, Do A, Lambert PF.J Virol. 2005 Dec;79(23):14769-80.パピローマウイルスのE7はretinoblastoma蛋白と結合するが、low r... 日記 ヘフティー 2009-10-22T19:44:19+09:00 role of human papillomavirus type 16 E7
in the papillomavirus life cycle.
Collins AS, Nakahara T, Do A, Lambert PF.
J Virol. 2005 Dec;79(23):14769-80.
パピローマウイルスのE7はretinoblastoma蛋白と結合するが、
low riskに比べhigh riskタイプは１０倍も結合力が強い。
結合すると処理されやすくなり、ｐRbはE2Fと結合して
E2Fを抑制していたのが、抑制がとれ、チェックポイント１が
G1→Sに移行し発癌につながる。
頸部癌は扁平上皮癌。
正常状態においても、扁平上皮は基底部に幹細胞があり
そこで増殖し、成熟しながら上層に移行しやがて脱落する。
HPVは自身では増殖できないで、感染細胞の酵素を利用する。
母細胞が増殖する基底細胞部でしか増殖できない。
基底細胞に感染するには上皮が損傷している必要がある。
損傷の原因はhard contactなのだろう。
この研究は基底細胞でHPVの増殖→pRbの減少。
pRbが細胞の成熟に役立っているのだが、HPVの感染、
とくにhigh riskではｐRBの低下が高度だから成熟が
より障害される→未分化細胞になると言ってるようにも
思うがよく理解できないのが本当のところ。
細胞回転、細胞分化、発癌の生物学、医学の一番の
ポイントの部分だから難しいのもしょうがないか？
pocket proteinsというのは、pRb,p107,p130などの
tumor suppressor蛋白のファミリーのことだが
どうしてポケットというのか書いてない。
結合して抑制する時に、ポケットへこみに抱き込むの
でないか？ ]]>オススメ・スポンサーサイト： ポイント | human | pocket | 酵素 | high | ファミリー | type | hard | contact | 医学 | life ]]> http://kaoya.seesaa.net/article/130470489.html 大腸菌（Escherichia coli）のR株から見つかった1番目の制限酵素えこあーるわんEcoRⅠで２本鎖環状DNAウイルスのpapillomavirusを切り切断点を時計状の１２時とする。２本の内の１本は相補的なナンセンス。１２時から６時ごろまでが初期遺伝子領域early regionでウイルス増殖に関係するE1,E2,E4,E5,E6,E7の遺伝子情報がある。これ等がE6,E7,E1,E2,E5の順に並びE5はE4に重なる。E3がないのは意味があるのだろうが不明。E1... 日記 ヘフティー 2009-10-17T11:02:07+09:00 えこあーるわんEcoRⅠで２本鎖環状DNAウイルスのpapillomavirusを
切り切断点を時計状の１２時とする。２本の内の１本は相補的な
ナンセンス。
１２時から６時ごろまでが初期遺伝子領域early regionで
ウイルス増殖に関係するE1,E2,E4,E5,E6,E7の遺伝子情報がある。
これ等がE6,E7,E1,E2,E5の順に並びE5はE4に重なる。
E3がないのは意味があるのだろうが不明。E1は領域が広い。
６時から１１時あたりまで後期遺伝子領域でカプシッドを
つくるL1,L2がある。１１時から１２時あたりはURR。
upstream regulately regionと呼ばれOR複製開始地点や
promotorがある。
E1は読み込みを開始するためのヘリカーゼにより２本鎖DNAを
ほぐしてDNAを外部にさらけ出し、プライマーやDNAポリメラーゼ
を使って読み込みを開始する。
E2は転写因子としてE1を管理しているらしい。
E6,E7が癌化の中心をして重要。別記。
]]>オススメ・スポンサーサイト： 時計 | ウイルス | 酵素 | プライマー | early ]]> http://kaoya.seesaa.net/article/130281293.html 日本でもhuman papillomavirusに対するワクチンが認可されるという。肝炎でのHBS抗原にあたる、late蛋白１，２で感作する。１６，１８の２つにタイプを対象にするものと１６，１８、６，１１の４タイプを対象にするものがある。頸部がんは大部分が１６型、ついで１８型。その他も少数ずつある。６，１１型は尖形コンジローム目的。少数の他の型には効かない。二つ用を選ぶ理由は解からないが値段が安いのか 日記 ヘフティー 2009-10-14T23:05:22+09:00 認可されるという。
肝炎でのHBS抗原にあたる、late蛋白１，２で感作
する。
１６，１８の２つにタイプを対象にするものと
１６，１８、６，１１の４タイプを対象にする
ものがある。
頸部がんは大部分が１６型、ついで１８型。その他も
少数ずつある。６，１１型は尖形コンジローム目的。
少数の他の型には効かない。
二つ用を選ぶ理由は解からないが値段が安いのか ]]>オススメ・スポンサーサイト： human | その他 ]]> http://kaoya.seesaa.net/article/130108952.html human papillomavirusには多くの種類があり、cutaneous typeとmucosal typeがある。更にbenign proliferative のものと、malignantなものがあり、low risk,high riskと言われている。type 16(HPV16)はその代表。papillomavirusの翻訳は７つのORF（E1-E7）Eは初期early.二つのORF(L1-L2)LはlateがありE6はP53,E7はpRbと結合することが解かって... 日記 ヘフティー 2009-10-12T17:29:24+09:00 mucosal typeがある。
更にbenign proliferative のものと、malignantなものがあり、
low risk,high riskと言われている。type 16(HPV16)はその代表。
papillomavirusの翻訳は７つのORF（E1-E7）Eは初期early.
二つのORF(L1-L2)LはlateがありE6はP53,E7はpRbと結合する
ことが解かっていた。

Induction of pRb degradation by the human papillomavirus type 16 E7 protein
is essential to efficiently overcome p16INK4a-imposed G1 cell cycle Arrest.
Giarrè M, Tommasino M.
J Virol. 2001 May;75(10):4705-12.
通常のHPVにp16INK4aを加えるとKはキナーゼINはinhibitorだから、
発育を抑制する。G1からS期への移行を阻止する。
low riskのHPVであるHPV1のE7を加えても変化ないが、HPV１６のE7
を加えると増殖。pRbを測ると、増殖する場合はpRbが消失していた。
HPV16のアミノ酸配列に変化した部分があった。
この変化がpRbのプロテアソーム分解を亢進させるらしい。 ]]>オススメ・スポンサーサイト： high | human | type | cell | early | アミノ酸 | 翻訳 | cycle ]]> http://kaoya.seesaa.net/article/129911736.html 1, Identification of an acquired JAK2 mutation in polycythemia vera.Zhao R, Xing S, Li Z, Fu X, Li Q, Krantz SB, Zhao ZJ.Vanderbilt University, Nashville, Tennessee J Biol Chem. 2005 Jun 17;280(24):22788-92. ２４人のPVの患者で２０人にJAK2のtyrosine kina... 日記 ヘフティー 2009-10-09T22:04:09+09:00 Identification of an acquired JAK2 mutation in polycythemia vera.
Zhao R, Xing S, Li Z, Fu X, Li Q, Krantz SB, Zhao ZJ.
Vanderbilt University, Nashville, Tennessee
J Biol Chem. 2005 Jun 17;280(24):22788-92.
２４人のPVの患者で２０人にJAK2のtyrosine kinaseの６１７番目の
バリンがフェニルアラニンになっていた。

その後、PVや血小板増多症や骨髄繊維症でこの変化がみられた。
２、
CYT387, a selective JAK1/JAK2 inhibitor:
in vitro assessment of kinase selectivity and preclinical studies
using cell lines and primary cells from polycythemia vera patients.
Pardanani A, Lasho T, Smith G, Burns CJ, Fantino E, Tefferi A.
Leukemia. 2009 Aug;23(8):1441-5.
そこを狙った薬剤が開発されている。 ]]>オススメ・スポンサーサイト： cell | 繊維 | University | Smith | mutation | from ]]> http://kaoya.seesaa.net/article/129842848.html インターフェロンαの受容体はIFNαR1とIFNαR2ｂとIFNαR2cの３部分から成り、リガンドIFNαはIFNαR1にくっつく。するとR2bとR2cが変化して３つが３量体をつくる。未刺激常態の時、IFNα１の末端にTyk2とJak1がついている。IFNR2cにも、STAT1ｂとSTAT2が付いている。リガンドが付くと、Tyk2とJak1はIFNαR1のCOOH端を燐酸化する。３量体になり３者が接近するとTyk2toJak1は両方のSTATを燐酸化する。活性化した両者のST... 日記 ヘフティー 2009-10-09T01:15:05+09:00 から成り、リガンドIFNαはIFNαR1にくっつく。するとR2bとR2cが変化
して３つが３量体をつくる。
未刺激常態の時、IFNα１の末端にTyk2とJak1がついている。
IFNR2cにも、STAT1ｂとSTAT2が付いている。
リガンドが付くと、Tyk2とJak1はIFNαR1のCOOH端を燐酸化する。
３量体になり３者が接近するとTyk2toJak1は両方のSTATを燐酸化
する。活性化した両者のSTATは２量体を作り、受容体から離れ
核に移行しDNAに作用する。
JAKがJanus kinaseであり
STATはsiganal transducer and activation of transcriptionである。
JAKにはJAK1からJAK３まであり、STATも１から６まである。
インターフェロンのαとγと同様に、インターロイキンも
同じような機構があり、JAKやSTATの組み合わせが違うらしい。
ヤーヌスキナーゼに活性型と抑制型があってそこがヤーヌスの
２面性らしいがそこはよく解からない。
チロジンキナーゼの分類に受容体型キナーゼと非受容体型
キナーゼに分類され、JAKがその非受容体型の代表として
書かれているが、受容体の上流、下流とどこが違うのか
解からない。
ヤーヌスの言葉が面白いから取り上げたがその重要性は
解からない。 ]]>